翌日正午，道宣引领孙思邈入净慈庵，执事尼僧说住持已知，引二人去上师精舍，临近却见明净上师在一小尼扶持下出舍亲迎，道宣与孙思邈远远看见明净师瘦骨伶仃似会随风而去，二人忙迎上去一同行礼，道宣说：“拜见上师。”孙思邈说：“上师不宜出外，当心风寒。”
明净住持虽已近古稀之年又大病未愈，形销骨立，但目含慈悲神采不减，乐呵呵说道。“早已听闻香客说起华原孙医师，医术精湛，仁心仁术，却不知还如此年轻，今日有道宣师和孙医师加持，老尼或可再诵佛几年。”
在明净师精舍里，孙思邈听明净师讲了这一年多的治病经过，观察明净师面色和气息后，细细切了脉，对明净病症已心中有数。曾听僧人们说明净尼师怕是要升天了，心想明净师虽是德高望重名传千里，但年纪也才不过七旬吧，对一个修行至高的佛门人，这个年纪还不算大。
明净微微笑道：“多谢道宣师和孙医师为我担忧，老尼这病已成顽疾，药石难奏。二位看过早些下山吧，庵里还有染疾者，不要再连累道宣师和孙医师。想来是我明净修持无方，神意如此，我一去寺便安。”
孙思邈道：“明净上师大发慈悲，众生皆由衷祈祷上师寿与天齐，依我看，上师疾病久治不愈，必是与寺内环境、饮食有关。”
“出家人素以简单谷蔬果腹，无需更多。”
孙崽邈已与小尼问过上师饮食情况，知上师在庵里人多而食品匮乏之时，总是把自己的食物让给他人，常吃其他修行者的残羹剩饭，有时食物剩几天发馊不舍弃之，亦食之。孙思邈心知上师之病与食物有极大关系，发霉腐败食物感染肠腑，形成惯性泻痢，便劝上师不能再吃残剩时久的食物。
明净说：“确如孙医师所言，但有剩余饭食总舍不得丢弃，一谷一蔬皆珍贵不忍暴殄天物。”
孙思邈：“我知上师慈悲为怀节衣缩食，但眼下年高体弱，要想根治此疾，须从一粥一茶做起。”。
明净笑道：“好，”谨遵医嘱。
“治愈上师痼疾，民医有一法，请上师移尊暂离住持屋，另辟一地修行如常，除服我方药外，每日熬煮新粥辅以食疗，一月内必除病根。”
明净师再次颔首：“好，谨遵医嘱。”
返回净业寺的路上，孙思邈心事重重，一路不语。道宣心知其在苦思医治法则，回到寺里坐定才问道：“可有良方？”
孙思邈说：“良方还谈不上。明净师身子太虚弱了，病情危重，体能耗尽，须有妥善之法。吾察其脉，为虚证久痢，虚实错杂，若扶正补益，则滞积不去，再行通导又恐伤正气，眼下只能虚实兼顾，扶正祛邪，养阴清肠。然后以食疗补益，温养阳气，逐步强体。”
道宣：“去年明净上师病重时，皇上亲派巢元方太医前来医治，当时有所好转，但时隔不久又复发，眼下已成危重之势。”
孙思邈：“想要医好明净师病患难度很大，屡治屡发，经年不愈已成顽疾。邪气壅滞肠中，肠腑无力传导，须先祛除邪气之壅滞，祛除腐败之脂脓，恢复肠腑功能，避免气血之凝滞，脂膜血络之损伤，此为治本之法。首先清除肠中之湿热、疫毒、冷积，先改善饮食居住环境，然后再用清热、解毒、导滞、通下等法。改善腹痛、里急后重、下痢脓血等临床症状。”
孙思邈沉浸在医治思维里，意犹未尽，又说：“这一次定要从治本入手，”调气和血，顺畅肠腑凝滞之气血，恢复肠道传送功能，促进损伤之脂膜血络尽早修复活血化瘀、去腐生肌。另外，明净上师疾患反复发作，长期服用湿热痢、疫毒痢方药，苦寒之药损伤胃气，又虚不受补，须得先泄后补先表后本，扶正祛邪。”
道宣击掌道：“好，果然不同！孙医师明辨义理，取法于道，定能医好明净师痼疾。”
孙思邈：“亦曾听闻，太医博士巢元方曾不顾年高亲寺为明净医治，时有所缓不久又复发，尔后还有其他几位大医出手，亦未能根绝。我总觉得其中必有缘故，须细细勘查。我游历江湖多年曾多次遇霍乱患者，经手治疗数百人，还有一些辨证体会。也有一些验方偏方，我需要在净慈庵附近住个十天半月，仔细观察明师身体变化，找出病因。”
“好，你有此胆识必能突破危局。净慈庵旁有一独修禅师法堂，你可在法堂小住，去净慈庵很方便。”
明净尼师在终南山一带名望甚高，所在尼姑庵也历次修葺、扩大，信徒遍布长安，孙思邈在沣峪时就听闻尼师，这是终南山最大的一座尼姑庵。战乱灾荒年月里，净慈庵收留四处逃难至此的女信徒，也曾有皇宫贵胄的家眷悄悄潜于此，亦有流落至此的外乡难民，孤女寡母，流浪弱女，无论贫富贵贱，明净一律敞开大门。
去年春上，霍乱爆发时，周边信徒、灾民无处求医，争相涌进庵里。庵里一度爆棚，明净住持连日安置，搭建临时庵棚让所有人容身，粮食不够，明净师向其他寺庙求借，带尼姑们上山采蕨根野菜给信徒煮菜粥，庵里有一口粮食绝不让信徒受饿。明净请来医僧施医送药，亲自为难民做斋饭，有时一口剩饭就是明净一天的口粮。有时难民散去，剩饭几天吃不完，明净舍不得丢弃，一连数天吃剩饭。持续月余，庵里尼众数人染疾，明净亦染病。之后时时发作，或一月一发，或一月数发，发即迅猛几乎至死。尼姑们四处为上师求医，甚至惊动了太医署。太医署令巢元方是名满天下的大医，感佩明净住持德行，亲自给她诊疗。明净住持服药之后，一时缓解过后又发。就这样持续一年多总也不能去根，眼见得骨瘦如柴，命悬一线。
孙思邈在法师茅棚住下来，清晨入庵，让执事在寺后院僻一清静禅房，换干净卧具，安置明净师暂居，亲自煮粥煎药，至夜乃归。危期过后又几次化裁药方，如是过了半个多月，明净师一天天好起来。
一个多月后，净慈庵来一位尼姑传话，上师痊愈，不仅一直未犯痢病，而且体质一天天见好。
是夜，孙思邈记录下这个病案，《千金要方·膀胱腑·霍乱第六》篇这样记载：“武德中，有德行尼名明净，患此已久，或一月一发，或一月再发，发即至死。时在朝太医亦不能识。余以霍乱治之处此方得愈。故疏而记之。药方如下：虎掌、薇衔各二两，枳实、附子、人参、槟榔、干姜各三两，厚朴六两 ，皂荚三寸，白术五两。上十味，末之，蜜丸如梧子，酒下二十丸，日三。”
明净师康复，孙思邈心中大慰，连夜赶抄几卷未写完的书稿，准备离开净业寺。
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作者寄语: 孙思邈终于治好已尼师顽疾，把这个病案写入《千金要方 膀胱腑·霍乱第六》篇中。